科学万能の現代社会…。その裏で突如として現れる闇の住人・あやかし妖魔。人々に仇なす邪なあやかし妖魔たちを人知れず退治する戦士たちがいた。その名は、影をもって闇を制す、討魔戦士コウガイガー！コウガイガーの紅一点・セイラは秘宝を守り約束の場所へ届けるためひとりで任務を遂行する。だが、その時セイラを追って現れる新たなあやかし妖魔…。度重なる戦闘により傷つくセイラ。果たして、セイラの運命や如何に…？！